Cuối thế kỷ 17 đánh dấu sự suy tàn của Khối thịnh vượng chung, một sự suy giảm thể hiện trong tình trạng sửa chữa chung của pháo đài. Chiến tranh phương Bắc vĩ đại không tha cho Zamość, vì vào ngày 11 tháng 2 năm 1703, các đơn vị Thụy Điển dưới quyền Tướng Magnus Stenbock đã tiếp cận thành trì và bao vây nó. Tuy nhiên, sau một tuần, quân Thụy Điển đã rút lui, để trở lại vào năm sau với quân đội bổ sung. Những người bảo vệ Ba Lan, chỉ có 260 binh lính, không thể chống lại những kẻ tấn công và nhanh chóng đầu hàng. Sự chiếm đóng của Thụy Điển rất ngắn ngủi. Vào năm 1705, binh lính Nga, với sự cho phép của Ordynat Tomasz Jozef Zamoyski, đã vào Zamość. 1000 đồn trú của Nga vẫn đóng ở đó cho đến tháng 5 năm 1706.